Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Setd4P58467 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Setd4P58467 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Setd4P58467 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Setd4P58467 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Setd4P58467 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Setd4P58467 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Setd4P58467 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Setd4P58467 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Setd4P58467 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Setd4P58467 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Setd4P58467 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Setd4P58467 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Setd4P58467 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Setd4P58467 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Setd4P58467 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Setd4P58467 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Setd4P58467 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Setd4P58467 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Setd4P58467 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Setd4P58467 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Setd4P58467 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Setd4P58467 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Setd4P58467 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Setd4P58467 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Setd4P58467 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Setd4P58467 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Setd4P58467 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Setd4P58467 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Setd4P58467 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Setd4P58467 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Setd4P58467 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Setd4P58467 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms