Protein–RNA interactions for Protein: P58462

Foxp1, Forkhead box protein P1, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp1P58462 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Foxp1P58462 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Foxp1P58462 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Foxp1P58462 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Foxp1P58462 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Foxp1P58462 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Foxp1P58462 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Foxp1P58462 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Foxp1P58462 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Foxp1P58462 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Foxp1P58462 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Foxp1P58462 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Foxp1P58462 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Foxp1P58462 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Foxp1P58462 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Foxp1P58462 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Foxp1P58462 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Foxp1P58462 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Foxp1P58462 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Foxp1P58462 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Foxp1P58462 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Foxp1P58462 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Foxp1P58462 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Foxp1P58462 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Foxp1P58462 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Foxp1P58462 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Foxp1P58462 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Foxp1P58462 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Foxp1P58462 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Foxp1P58462 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Foxp1P58462 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Foxp1P58462 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Foxp1P58462 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Foxp1P58462 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Foxp1P58462 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Foxp1P58462 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Foxp1P58462 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Foxp1P58462 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Foxp1P58462 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Foxp1P58462 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Foxp1P58462 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Foxp1P58462 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Foxp1P58462 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Foxp1P58462 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Foxp1P58462 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Foxp1P58462 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Foxp1P58462 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Foxp1P58462 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Foxp1P58462 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Foxp1P58462 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Foxp1P58462 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Foxp1P58462 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Foxp1P58462 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Foxp1P58462 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Foxp1P58462 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Foxp1P58462 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Foxp1P58462 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Foxp1P58462 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Foxp1P58462 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Foxp1P58462 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Foxp1P58462 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Foxp1P58462 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Foxp1P58462 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Foxp1P58462 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Foxp1P58462 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Foxp1P58462 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Foxp1P58462 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Foxp1P58462 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Foxp1P58462 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Foxp1P58462 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Foxp1P58462 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Foxp1P58462 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Foxp1P58462 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Foxp1P58462 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Foxp1P58462 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Foxp1P58462 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Foxp1P58462 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Foxp1P58462 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Foxp1P58462 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Foxp1P58462 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Foxp1P58462 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Foxp1P58462 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Foxp1P58462 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Foxp1P58462 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Foxp1P58462 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Foxp1P58462 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Foxp1P58462 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Foxp1P58462 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Foxp1P58462 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Foxp1P58462 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Foxp1P58462 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Foxp1P58462 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Foxp1P58462 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Foxp1P58462 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Foxp1P58462 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Foxp1P58462 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Foxp1P58462 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Foxp1P58462 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Foxp1P58462 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Foxp1P58462 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms