Protein–RNA interactions for Protein: P58334

Klf16, Krueppel-like factor 16, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf16P58334 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klf16P58334 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Klf16P58334 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Klf16P58334 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klf16P58334 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klf16P58334 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klf16P58334 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klf16P58334 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klf16P58334 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klf16P58334 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klf16P58334 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klf16P58334 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klf16P58334 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klf16P58334 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klf16P58334 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klf16P58334 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klf16P58334 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klf16P58334 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klf16P58334 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klf16P58334 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klf16P58334 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klf16P58334 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klf16P58334 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klf16P58334 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klf16P58334 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klf16P58334 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klf16P58334 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klf16P58334 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klf16P58334 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klf16P58334 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Klf16P58334 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Klf16P58334 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Klf16P58334 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Klf16P58334 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Klf16P58334 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Klf16P58334 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klf16P58334 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klf16P58334 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klf16P58334 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klf16P58334 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klf16P58334 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klf16P58334 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Klf16P58334 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klf16P58334 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klf16P58334 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klf16P58334 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klf16P58334 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klf16P58334 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klf16P58334 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klf16P58334 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klf16P58334 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klf16P58334 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klf16P58334 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klf16P58334 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klf16P58334 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klf16P58334 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klf16P58334 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klf16P58334 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klf16P58334 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klf16P58334 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Klf16P58334 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klf16P58334 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klf16P58334 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klf16P58334 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klf16P58334 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klf16P58334 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klf16P58334 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klf16P58334 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klf16P58334 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf16P58334 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf16P58334 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf16P58334 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf16P58334 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf16P58334 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf16P58334 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf16P58334 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf16P58334 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf16P58334 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf16P58334 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf16P58334 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klf16P58334 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klf16P58334 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klf16P58334 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klf16P58334 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klf16P58334 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klf16P58334 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klf16P58334 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klf16P58334 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klf16P58334 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klf16P58334 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klf16P58334 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klf16P58334 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klf16P58334 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klf16P58334 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klf16P58334 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klf16P58334 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klf16P58334 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klf16P58334 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Klf16P58334 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf16P58334 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms