Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NcstnP57716 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NcstnP57716 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NcstnP57716 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NcstnP57716 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NcstnP57716 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NcstnP57716 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NcstnP57716 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NcstnP57716 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NcstnP57716 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NcstnP57716 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NcstnP57716 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NcstnP57716 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NcstnP57716 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NcstnP57716 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NcstnP57716 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NcstnP57716 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NcstnP57716 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NcstnP57716 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NcstnP57716 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NcstnP57716 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NcstnP57716 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NcstnP57716 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NcstnP57716 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NcstnP57716 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NcstnP57716 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NcstnP57716 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NcstnP57716 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NcstnP57716 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NcstnP57716 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NcstnP57716 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NcstnP57716 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NcstnP57716 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NcstnP57716 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NcstnP57716 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NcstnP57716 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NcstnP57716 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NcstnP57716 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NcstnP57716 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NcstnP57716 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NcstnP57716 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NcstnP57716 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NcstnP57716 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NcstnP57716 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NcstnP57716 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NcstnP57716 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NcstnP57716 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NcstnP57716 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NcstnP57716 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NcstnP57716 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NcstnP57716 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NcstnP57716 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NcstnP57716 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NcstnP57716 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NcstnP57716 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NcstnP57716 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NcstnP57716 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NcstnP57716 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NcstnP57716 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NcstnP57716 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NcstnP57716 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NcstnP57716 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NcstnP57716 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NcstnP57716 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NcstnP57716 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NcstnP57716 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NcstnP57716 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NcstnP57716 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NcstnP57716 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NcstnP57716 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NcstnP57716 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NcstnP57716 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NcstnP57716 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NcstnP57716 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NcstnP57716 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NcstnP57716 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NcstnP57716 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NcstnP57716 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NcstnP57716 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NcstnP57716 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NcstnP57716 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NcstnP57716 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NcstnP57716 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NcstnP57716 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NcstnP57716 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NcstnP57716 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NcstnP57716 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NcstnP57716 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NcstnP57716 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NcstnP57716 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NcstnP57716 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NcstnP57716 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NcstnP57716 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NcstnP57716 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NcstnP57716 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NcstnP57716 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NcstnP57716 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
NcstnP57716 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NcstnP57716 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NcstnP57716 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms