Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp5P56399 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp5P56399 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp5P56399 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp5P56399 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp5P56399 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp5P56399 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp5P56399 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp5P56399 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp5P56399 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp5P56399 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp5P56399 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp5P56399 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp5P56399 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp5P56399 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp5P56399 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp5P56399 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp5P56399 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp5P56399 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp5P56399 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp5P56399 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp5P56399 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp5P56399 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp5P56399 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp5P56399 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp5P56399 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp5P56399 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp5P56399 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp5P56399 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp5P56399 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp5P56399 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp5P56399 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp5P56399 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp5P56399 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp5P56399 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp5P56399 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp5P56399 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp5P56399 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp5P56399 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp5P56399 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp5P56399 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp5P56399 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp5P56399 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp5P56399 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp5P56399 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp5P56399 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp5P56399 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp5P56399 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp5P56399 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp5P56399 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp5P56399 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp5P56399 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp5P56399 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp5P56399 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp5P56399 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp5P56399 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp5P56399 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp5P56399 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp5P56399 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp5P56399 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp5P56399 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp5P56399 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp5P56399 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp5P56399 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp5P56399 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp5P56399 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp5P56399 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp5P56399 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp5P56399 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp5P56399 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp5P56399 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp5P56399 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp5P56399 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp5P56399 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp5P56399 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp5P56399 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp5P56399 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp5P56399 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp5P56399 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp5P56399 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp5P56399 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp5P56399 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp5P56399 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp5P56399 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp5P56399 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp5P56399 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp5P56399 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp5P56399 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp5P56399 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Usp5P56399 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp5P56399 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp5P56399 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp5P56399 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp5P56399 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp5P56399 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp5P56399 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp5P56399 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp5P56399 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp5P56399 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp5P56399 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms