Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sh3bp1P55194 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh3bp1P55194 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh3bp1P55194 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh3bp1P55194 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh3bp1P55194 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh3bp1P55194 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3bp1P55194 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3bp1P55194 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3bp1P55194 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3bp1P55194 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3bp1P55194 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3bp1P55194 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3bp1P55194 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3bp1P55194 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3bp1P55194 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3bp1P55194 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3bp1P55194 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3bp1P55194 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3bp1P55194 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3bp1P55194 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3bp1P55194 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3bp1P55194 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3bp1P55194 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3bp1P55194 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3bp1P55194 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3bp1P55194 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3bp1P55194 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3bp1P55194 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3bp1P55194 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3bp1P55194 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3bp1P55194 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3bp1P55194 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3bp1P55194 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3bp1P55194 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3bp1P55194 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3bp1P55194 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3bp1P55194 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3bp1P55194 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3bp1P55194 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3bp1P55194 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3bp1P55194 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3bp1P55194 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3bp1P55194 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3bp1P55194 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3bp1P55194 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3bp1P55194 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp1P55194 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp1P55194 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp1P55194 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp1P55194 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms