Protein–RNA interactions for Protein: P55096

Abcd3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd3P55096 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcd3P55096 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcd3P55096 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcd3P55096 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcd3P55096 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcd3P55096 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcd3P55096 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcd3P55096 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcd3P55096 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcd3P55096 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcd3P55096 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcd3P55096 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcd3P55096 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcd3P55096 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcd3P55096 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcd3P55096 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcd3P55096 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcd3P55096 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcd3P55096 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcd3P55096 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcd3P55096 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcd3P55096 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcd3P55096 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcd3P55096 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcd3P55096 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcd3P55096 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcd3P55096 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcd3P55096 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcd3P55096 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcd3P55096 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcd3P55096 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcd3P55096 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcd3P55096 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcd3P55096 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcd3P55096 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcd3P55096 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcd3P55096 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcd3P55096 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcd3P55096 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcd3P55096 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcd3P55096 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcd3P55096 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcd3P55096 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcd3P55096 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcd3P55096 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcd3P55096 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcd3P55096 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcd3P55096 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcd3P55096 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcd3P55096 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcd3P55096 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcd3P55096 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcd3P55096 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcd3P55096 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcd3P55096 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcd3P55096 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcd3P55096 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcd3P55096 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Abcd3P55096 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms