Protein–RNA interactions for Protein: P54761

Ephb4, Ephrin type-B receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb4P54761 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ephb4P54761 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ephb4P54761 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ephb4P54761 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ephb4P54761 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ephb4P54761 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ephb4P54761 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ephb4P54761 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ephb4P54761 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ephb4P54761 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ephb4P54761 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ephb4P54761 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ephb4P54761 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ephb4P54761 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ephb4P54761 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ephb4P54761 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ephb4P54761 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ephb4P54761 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ephb4P54761 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ephb4P54761 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ephb4P54761 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ephb4P54761 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ephb4P54761 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ephb4P54761 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ephb4P54761 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ephb4P54761 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ephb4P54761 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ephb4P54761 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ephb4P54761 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ephb4P54761 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ephb4P54761 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ephb4P54761 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ephb4P54761 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ephb4P54761 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ephb4P54761 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ephb4P54761 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ephb4P54761 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ephb4P54761 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ephb4P54761 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ephb4P54761 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ephb4P54761 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ephb4P54761 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ephb4P54761 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ephb4P54761 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ephb4P54761 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ephb4P54761 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ephb4P54761 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ephb4P54761 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ephb4P54761 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ephb4P54761 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ephb4P54761 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ephb4P54761 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ephb4P54761 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ephb4P54761 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ephb4P54761 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ephb4P54761 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ephb4P54761 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ephb4P54761 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ephb4P54761 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ephb4P54761 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ephb4P54761 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ephb4P54761 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ephb4P54761 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ephb4P54761 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ephb4P54761 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ephb4P54761 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ephb4P54761 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ephb4P54761 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ephb4P54761 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ephb4P54761 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ephb4P54761 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ephb4P54761 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ephb4P54761 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ephb4P54761 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ephb4P54761 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ephb4P54761 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ephb4P54761 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ephb4P54761 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ephb4P54761 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ephb4P54761 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ephb4P54761 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ephb4P54761 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ephb4P54761 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ephb4P54761 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ephb4P54761 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ephb4P54761 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ephb4P54761 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ephb4P54761 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ephb4P54761 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ephb4P54761 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ephb4P54761 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ephb4P54761 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ephb4P54761 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ephb4P54761 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ephb4P54761 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ephb4P54761 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ephb4P54761 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ephb4P54761 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ephb4P54761 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ephb4P54761 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms