Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cacnb3P54285 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cacnb3P54285 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cacnb3P54285 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cacnb3P54285 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cacnb3P54285 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cacnb3P54285 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cacnb3P54285 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cacnb3P54285 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cacnb3P54285 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cacnb3P54285 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cacnb3P54285 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cacnb3P54285 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cacnb3P54285 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cacnb3P54285 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cacnb3P54285 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cacnb3P54285 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cacnb3P54285 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cacnb3P54285 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cacnb3P54285 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cacnb3P54285 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cacnb3P54285 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cacnb3P54285 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cacnb3P54285 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Cacnb3P54285 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Cacnb3P54285 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cacnb3P54285 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cacnb3P54285 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cacnb3P54285 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cacnb3P54285 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cacnb3P54285 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cacnb3P54285 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cacnb3P54285 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cacnb3P54285 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cacnb3P54285 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cacnb3P54285 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cacnb3P54285 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cacnb3P54285 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cacnb3P54285 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cacnb3P54285 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cacnb3P54285 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Cacnb3P54285 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Cacnb3P54285 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cacnb3P54285 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cacnb3P54285 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cacnb3P54285 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cacnb3P54285 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cacnb3P54285 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Cacnb3P54285 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cacnb3P54285 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cacnb3P54285 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cacnb3P54285 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cacnb3P54285 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cacnb3P54285 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cacnb3P54285 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cacnb3P54285 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Cacnb3P54285 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cacnb3P54285 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cacnb3P54285 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cacnb3P54285 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cacnb3P54285 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cacnb3P54285 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cacnb3P54285 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cacnb3P54285 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cacnb3P54285 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cacnb3P54285 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cacnb3P54285 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cacnb3P54285 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cacnb3P54285 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cacnb3P54285 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cacnb3P54285 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cacnb3P54285 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Cacnb3P54285 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Cacnb3P54285 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Cacnb3P54285 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cacnb3P54285 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cacnb3P54285 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Cacnb3P54285 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cacnb3P54285 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cacnb3P54285 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cacnb3P54285 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cacnb3P54285 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cacnb3P54285 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cacnb3P54285 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cacnb3P54285 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cacnb3P54285 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cacnb3P54285 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cacnb3P54285 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cacnb3P54285 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cacnb3P54285 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cacnb3P54285 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cacnb3P54285 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cacnb3P54285 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cacnb3P54285 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cacnb3P54285 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Cacnb3P54285 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cacnb3P54285 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cacnb3P54285 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cacnb3P54285 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cacnb3P54285 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms