Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ClgnP52194 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ClgnP52194 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ClgnP52194 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ClgnP52194 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ClgnP52194 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ClgnP52194 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ClgnP52194 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ClgnP52194 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ClgnP52194 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ClgnP52194 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ClgnP52194 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ClgnP52194 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ClgnP52194 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ClgnP52194 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ClgnP52194 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ClgnP52194 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ClgnP52194 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ClgnP52194 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ClgnP52194 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ClgnP52194 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ClgnP52194 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ClgnP52194 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ClgnP52194 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ClgnP52194 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ClgnP52194 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ClgnP52194 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ClgnP52194 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ClgnP52194 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ClgnP52194 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ClgnP52194 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ClgnP52194 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ClgnP52194 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ClgnP52194 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ClgnP52194 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ClgnP52194 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ClgnP52194 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ClgnP52194 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ClgnP52194 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ClgnP52194 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ClgnP52194 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ClgnP52194 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ClgnP52194 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ClgnP52194 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ClgnP52194 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ClgnP52194 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ClgnP52194 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ClgnP52194 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ClgnP52194 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ClgnP52194 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ClgnP52194 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ClgnP52194 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ClgnP52194 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ClgnP52194 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ClgnP52194 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ClgnP52194 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ClgnP52194 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ClgnP52194 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ClgnP52194 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ClgnP52194 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ClgnP52194 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ClgnP52194 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ClgnP52194 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ClgnP52194 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ClgnP52194 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ClgnP52194 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ClgnP52194 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ClgnP52194 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ClgnP52194 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ClgnP52194 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ClgnP52194 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ClgnP52194 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ClgnP52194 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ClgnP52194 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ClgnP52194 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ClgnP52194 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ClgnP52194 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ClgnP52194 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ClgnP52194 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ClgnP52194 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ClgnP52194 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ClgnP52194 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ClgnP52194 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ClgnP52194 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ClgnP52194 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ClgnP52194 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ClgnP52194 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ClgnP52194 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ClgnP52194 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ClgnP52194 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ClgnP52194 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ClgnP52194 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ClgnP52194 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ClgnP52194 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ClgnP52194 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ClgnP52194 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ClgnP52194 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ClgnP52194 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ClgnP52194 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ClgnP52194 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms