Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccr5P51682 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccr5P51682 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccr5P51682 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccr5P51682 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccr5P51682 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccr5P51682 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccr5P51682 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccr5P51682 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccr5P51682 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccr5P51682 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccr5P51682 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccr5P51682 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccr5P51682 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccr5P51682 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccr5P51682 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccr5P51682 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccr5P51682 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccr5P51682 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccr5P51682 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccr5P51682 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccr5P51682 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccr5P51682 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccr5P51682 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccr5P51682 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccr5P51682 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccr5P51682 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccr5P51682 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccr5P51682 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccr5P51682 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccr5P51682 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccr5P51682 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccr5P51682 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccr5P51682 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccr5P51682 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccr5P51682 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccr5P51682 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccr5P51682 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccr5P51682 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccr5P51682 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccr5P51682 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccr5P51682 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccr5P51682 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccr5P51682 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccr5P51682 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccr5P51682 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccr5P51682 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccr5P51682 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccr5P51682 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccr5P51682 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccr5P51682 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccr5P51682 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccr5P51682 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccr5P51682 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccr5P51682 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccr5P51682 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccr5P51682 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccr5P51682 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccr5P51682 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccr5P51682 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccr5P51682 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccr5P51682 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccr5P51682 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccr5P51682 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccr5P51682 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccr5P51682 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccr5P51682 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccr5P51682 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccr5P51682 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccr5P51682 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccr5P51682 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccr5P51682 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccr5P51682 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccr5P51682 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccr5P51682 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccr5P51682 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccr5P51682 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccr5P51682 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccr5P51682 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccr5P51682 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccr5P51682 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccr5P51682 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccr5P51682 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccr5P51682 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccr5P51682 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccr5P51682 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccr5P51682 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccr5P51682 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccr5P51682 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccr5P51682 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccr5P51682 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccr5P51682 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccr5P51682 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccr5P51682 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccr5P51682 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccr5P51682 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccr5P51682 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccr5P51682 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccr5P51682 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccr5P51682 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms