Protein–RNA interactions for Protein: P51450

Rorc, Nuclear receptor ROR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorcP51450 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RorcP51450 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RorcP51450 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RorcP51450 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RorcP51450 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RorcP51450 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RorcP51450 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RorcP51450 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RorcP51450 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RorcP51450 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RorcP51450 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RorcP51450 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RorcP51450 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RorcP51450 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RorcP51450 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RorcP51450 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RorcP51450 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RorcP51450 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RorcP51450 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RorcP51450 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RorcP51450 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RorcP51450 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RorcP51450 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RorcP51450 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RorcP51450 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RorcP51450 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RorcP51450 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RorcP51450 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RorcP51450 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RorcP51450 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RorcP51450 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RorcP51450 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RorcP51450 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RorcP51450 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RorcP51450 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RorcP51450 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RorcP51450 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RorcP51450 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RorcP51450 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RorcP51450 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RorcP51450 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RorcP51450 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RorcP51450 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RorcP51450 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RorcP51450 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RorcP51450 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RorcP51450 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RorcP51450 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RorcP51450 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RorcP51450 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RorcP51450 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RorcP51450 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RorcP51450 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RorcP51450 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RorcP51450 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RorcP51450 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RorcP51450 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RorcP51450 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RorcP51450 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RorcP51450 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RorcP51450 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RorcP51450 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RorcP51450 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RorcP51450 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RorcP51450 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RorcP51450 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RorcP51450 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RorcP51450 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RorcP51450 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RorcP51450 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RorcP51450 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RorcP51450 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RorcP51450 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RorcP51450 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RorcP51450 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RorcP51450 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RorcP51450 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RorcP51450 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RorcP51450 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RorcP51450 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RorcP51450 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RorcP51450 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RorcP51450 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RorcP51450 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RorcP51450 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RorcP51450 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RorcP51450 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RorcP51450 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RorcP51450 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RorcP51450 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RorcP51450 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RorcP51450 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RorcP51450 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RorcP51450 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RorcP51450 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RorcP51450 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RorcP51450 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RorcP51450 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RorcP51450 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RorcP51450 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms