Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxc13P50207 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxc13P50207 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxc13P50207 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxc13P50207 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxc13P50207 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxc13P50207 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxc13P50207 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxc13P50207 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxc13P50207 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxc13P50207 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxc13P50207 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxc13P50207 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxc13P50207 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxc13P50207 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxc13P50207 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxc13P50207 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxc13P50207 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxc13P50207 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxc13P50207 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxc13P50207 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxc13P50207 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxc13P50207 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxc13P50207 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxc13P50207 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxc13P50207 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxc13P50207 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxc13P50207 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxc13P50207 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxc13P50207 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxc13P50207 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxc13P50207 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxc13P50207 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxc13P50207 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Hoxc13P50207 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Hoxc13P50207 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Hoxc13P50207 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc13P50207 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc13P50207 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc13P50207 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc13P50207 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc13P50207 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc13P50207 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxc13P50207 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxc13P50207 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxc13P50207 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxc13P50207 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxc13P50207 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxc13P50207 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxc13P50207 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxc13P50207 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxc13P50207 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxc13P50207 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxc13P50207 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxc13P50207 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxc13P50207 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxc13P50207 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxc13P50207 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxc13P50207 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxc13P50207 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxc13P50207 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxc13P50207 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxc13P50207 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxc13P50207 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxc13P50207 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxc13P50207 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxc13P50207 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxc13P50207 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxc13P50207 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxc13P50207 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxc13P50207 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxc13P50207 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxc13P50207 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxc13P50207 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxc13P50207 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxc13P50207 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxc13P50207 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxc13P50207 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxc13P50207 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxc13P50207 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc13P50207 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc13P50207 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc13P50207 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc13P50207 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc13P50207 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc13P50207 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc13P50207 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc13P50207 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc13P50207 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc13P50207 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc13P50207 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc13P50207 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc13P50207 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc13P50207 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc13P50207 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxc13P50207 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxc13P50207 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxc13P50207 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxc13P50207 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxc13P50207 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms