Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cav1P49817 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cav1P49817 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cav1P49817 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cav1P49817 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cav1P49817 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Cav1P49817 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cav1P49817 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cav1P49817 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cav1P49817 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cav1P49817 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cav1P49817 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cav1P49817 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cav1P49817 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cav1P49817 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cav1P49817 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cav1P49817 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cav1P49817 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cav1P49817 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cav1P49817 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Cav1P49817 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cav1P49817 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cav1P49817 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cav1P49817 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cav1P49817 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cav1P49817 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cav1P49817 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cav1P49817 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cav1P49817 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cav1P49817 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cav1P49817 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cav1P49817 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cav1P49817 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cav1P49817 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cav1P49817 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Cav1P49817 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cav1P49817 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cav1P49817 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cav1P49817 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cav1P49817 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cav1P49817 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cav1P49817 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cav1P49817 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cav1P49817 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cav1P49817 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cav1P49817 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cav1P49817 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cav1P49817 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cav1P49817 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cav1P49817 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cav1P49817 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cav1P49817 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cav1P49817 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cav1P49817 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cav1P49817 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cav1P49817 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cav1P49817 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cav1P49817 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cav1P49817 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cav1P49817 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cav1P49817 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cav1P49817 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cav1P49817 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cav1P49817 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cav1P49817 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cav1P49817 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cav1P49817 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cav1P49817 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cav1P49817 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cav1P49817 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cav1P49817 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cav1P49817 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cav1P49817 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cav1P49817 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cav1P49817 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cav1P49817 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cav1P49817 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cav1P49817 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cav1P49817 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cav1P49817 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cav1P49817 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cav1P49817 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cav1P49817 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cav1P49817 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cav1P49817 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cav1P49817 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cav1P49817 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cav1P49817 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cav1P49817 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cav1P49817 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cav1P49817 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cav1P49817 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cav1P49817 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cav1P49817 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cav1P49817 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cav1P49817 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Cav1P49817 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cav1P49817 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cav1P49817 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cav1P49817 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms