Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CitP49025 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CitP49025 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CitP49025 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CitP49025 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CitP49025 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CitP49025 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CitP49025 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CitP49025 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CitP49025 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CitP49025 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CitP49025 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CitP49025 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CitP49025 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CitP49025 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CitP49025 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CitP49025 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CitP49025 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CitP49025 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CitP49025 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CitP49025 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CitP49025 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CitP49025 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CitP49025 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CitP49025 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CitP49025 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CitP49025 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CitP49025 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CitP49025 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
CitP49025 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CitP49025 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
CitP49025 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CitP49025 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CitP49025 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CitP49025 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CitP49025 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CitP49025 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CitP49025 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CitP49025 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CitP49025 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CitP49025 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CitP49025 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CitP49025 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CitP49025 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CitP49025 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CitP49025 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CitP49025 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CitP49025 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CitP49025 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CitP49025 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CitP49025 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CitP49025 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CitP49025 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CitP49025 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CitP49025 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CitP49025 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CitP49025 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CitP49025 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CitP49025 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CitP49025 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CitP49025 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CitP49025 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CitP49025 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CitP49025 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CitP49025 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CitP49025 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CitP49025 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CitP49025 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CitP49025 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CitP49025 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CitP49025 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CitP49025 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CitP49025 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CitP49025 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CitP49025 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CitP49025 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CitP49025 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CitP49025 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CitP49025 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CitP49025 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CitP49025 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CitP49025 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CitP49025 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CitP49025 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CitP49025 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CitP49025 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CitP49025 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CitP49025 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CitP49025 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.27■■□□□ 1
CitP49025 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CitP49025 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CitP49025 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CitP49025 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CitP49025 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CitP49025 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CitP49025 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CitP49025 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CitP49025 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CitP49025 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CitP49025 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms