Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prox1P48437 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prox1P48437 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prox1P48437 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prox1P48437 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prox1P48437 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prox1P48437 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prox1P48437 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prox1P48437 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prox1P48437 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prox1P48437 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prox1P48437 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prox1P48437 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prox1P48437 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prox1P48437 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prox1P48437 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prox1P48437 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prox1P48437 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prox1P48437 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prox1P48437 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prox1P48437 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prox1P48437 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prox1P48437 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prox1P48437 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prox1P48437 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prox1P48437 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prox1P48437 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prox1P48437 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Prox1P48437 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Prox1P48437 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Prox1P48437 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prox1P48437 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Prox1P48437 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prox1P48437 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prox1P48437 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prox1P48437 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Prox1P48437 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prox1P48437 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prox1P48437 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prox1P48437 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prox1P48437 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prox1P48437 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prox1P48437 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prox1P48437 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prox1P48437 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prox1P48437 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Prox1P48437 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Prox1P48437 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Prox1P48437 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Prox1P48437 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Prox1P48437 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Prox1P48437 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prox1P48437 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prox1P48437 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prox1P48437 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms