Protein–RNA interactions for Protein: P47968

Rpia, Ribose-5-phosphate isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpiaP47968 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RpiaP47968 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RpiaP47968 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RpiaP47968 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RpiaP47968 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RpiaP47968 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RpiaP47968 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RpiaP47968 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RpiaP47968 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RpiaP47968 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RpiaP47968 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RpiaP47968 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RpiaP47968 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RpiaP47968 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RpiaP47968 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RpiaP47968 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RpiaP47968 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RpiaP47968 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RpiaP47968 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RpiaP47968 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RpiaP47968 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RpiaP47968 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RpiaP47968 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RpiaP47968 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RpiaP47968 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RpiaP47968 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RpiaP47968 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RpiaP47968 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RpiaP47968 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RpiaP47968 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RpiaP47968 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RpiaP47968 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RpiaP47968 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RpiaP47968 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RpiaP47968 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RpiaP47968 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RpiaP47968 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RpiaP47968 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RpiaP47968 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RpiaP47968 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RpiaP47968 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RpiaP47968 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RpiaP47968 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RpiaP47968 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RpiaP47968 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RpiaP47968 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RpiaP47968 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RpiaP47968 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RpiaP47968 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RpiaP47968 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RpiaP47968 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RpiaP47968 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RpiaP47968 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RpiaP47968 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RpiaP47968 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RpiaP47968 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RpiaP47968 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RpiaP47968 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RpiaP47968 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RpiaP47968 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RpiaP47968 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RpiaP47968 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RpiaP47968 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RpiaP47968 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RpiaP47968 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RpiaP47968 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RpiaP47968 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RpiaP47968 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RpiaP47968 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RpiaP47968 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RpiaP47968 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RpiaP47968 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RpiaP47968 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RpiaP47968 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RpiaP47968 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RpiaP47968 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RpiaP47968 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RpiaP47968 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RpiaP47968 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RpiaP47968 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RpiaP47968 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RpiaP47968 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RpiaP47968 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RpiaP47968 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RpiaP47968 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RpiaP47968 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RpiaP47968 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RpiaP47968 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RpiaP47968 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RpiaP47968 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RpiaP47968 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RpiaP47968 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RpiaP47968 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RpiaP47968 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RpiaP47968 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RpiaP47968 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RpiaP47968 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RpiaP47968 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RpiaP47968 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RpiaP47968 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.2 ms