Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pax9P47242 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Pax9P47242 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pax9P47242 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pax9P47242 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pax9P47242 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pax9P47242 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pax9P47242 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pax9P47242 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pax9P47242 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pax9P47242 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pax9P47242 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pax9P47242 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pax9P47242 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pax9P47242 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pax9P47242 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pax9P47242 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pax9P47242 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pax9P47242 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pax9P47242 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pax9P47242 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pax9P47242 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pax9P47242 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pax9P47242 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pax9P47242 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pax9P47242 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pax9P47242 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pax9P47242 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pax9P47242 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pax9P47242 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pax9P47242 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pax9P47242 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pax9P47242 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pax9P47242 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pax9P47242 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pax9P47242 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pax9P47242 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pax9P47242 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pax9P47242 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pax9P47242 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pax9P47242 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pax9P47242 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pax9P47242 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pax9P47242 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pax9P47242 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pax9P47242 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pax9P47242 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pax9P47242 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pax9P47242 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pax9P47242 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pax9P47242 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pax9P47242 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pax9P47242 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pax9P47242 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pax9P47242 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pax9P47242 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pax9P47242 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pax9P47242 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pax9P47242 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pax9P47242 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Pax9P47242 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pax9P47242 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pax9P47242 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pax9P47242 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pax9P47242 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pax9P47242 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pax9P47242 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pax9P47242 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pax9P47242 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pax9P47242 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pax9P47242 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pax9P47242 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pax9P47242 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pax9P47242 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pax9P47242 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pax9P47242 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pax9P47242 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Pax9P47242 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pax9P47242 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pax9P47242 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pax9P47242 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pax9P47242 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pax9P47242 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pax9P47242 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pax9P47242 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pax9P47242 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pax9P47242 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pax9P47242 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pax9P47242 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pax9P47242 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pax9P47242 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pax9P47242 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pax9P47242 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pax9P47242 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pax9P47242 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pax9P47242 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pax9P47242 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pax9P47242 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pax9P47242 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pax9P47242 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms