Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab11bP46638 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rab11bP46638 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab11bP46638 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab11bP46638 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab11bP46638 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab11bP46638 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab11bP46638 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab11bP46638 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab11bP46638 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab11bP46638 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab11bP46638 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab11bP46638 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab11bP46638 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab11bP46638 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab11bP46638 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab11bP46638 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab11bP46638 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab11bP46638 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab11bP46638 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab11bP46638 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab11bP46638 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab11bP46638 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab11bP46638 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab11bP46638 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab11bP46638 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab11bP46638 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab11bP46638 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab11bP46638 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab11bP46638 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab11bP46638 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab11bP46638 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab11bP46638 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab11bP46638 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab11bP46638 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab11bP46638 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab11bP46638 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab11bP46638 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab11bP46638 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab11bP46638 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab11bP46638 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab11bP46638 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab11bP46638 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab11bP46638 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab11bP46638 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab11bP46638 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab11bP46638 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab11bP46638 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab11bP46638 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab11bP46638 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab11bP46638 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab11bP46638 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab11bP46638 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab11bP46638 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab11bP46638 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab11bP46638 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab11bP46638 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab11bP46638 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab11bP46638 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab11bP46638 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab11bP46638 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab11bP46638 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab11bP46638 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rab11bP46638 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab11bP46638 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms