Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ItgavP43406 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ItgavP43406 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ItgavP43406 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ItgavP43406 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ItgavP43406 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ItgavP43406 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ItgavP43406 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ItgavP43406 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ItgavP43406 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ItgavP43406 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ItgavP43406 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ItgavP43406 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ItgavP43406 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ItgavP43406 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ItgavP43406 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ItgavP43406 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ItgavP43406 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ItgavP43406 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ItgavP43406 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ItgavP43406 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ItgavP43406 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ItgavP43406 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ItgavP43406 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ItgavP43406 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ItgavP43406 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ItgavP43406 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ItgavP43406 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ItgavP43406 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ItgavP43406 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ItgavP43406 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ItgavP43406 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ItgavP43406 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ItgavP43406 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ItgavP43406 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ItgavP43406 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ItgavP43406 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ItgavP43406 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ItgavP43406 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ItgavP43406 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ItgavP43406 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ItgavP43406 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ItgavP43406 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ItgavP43406 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ItgavP43406 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ItgavP43406 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ItgavP43406 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ItgavP43406 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ItgavP43406 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ItgavP43406 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ItgavP43406 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ItgavP43406 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ItgavP43406 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ItgavP43406 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ItgavP43406 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ItgavP43406 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ItgavP43406 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ItgavP43406 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ItgavP43406 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ItgavP43406 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ItgavP43406 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ItgavP43406 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ItgavP43406 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ItgavP43406 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ItgavP43406 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ItgavP43406 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ItgavP43406 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ItgavP43406 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ItgavP43406 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ItgavP43406 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ItgavP43406 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ItgavP43406 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ItgavP43406 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ItgavP43406 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ItgavP43406 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ItgavP43406 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ItgavP43406 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ItgavP43406 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ItgavP43406 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ItgavP43406 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ItgavP43406 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ItgavP43406 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ItgavP43406 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ItgavP43406 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ItgavP43406 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ItgavP43406 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ItgavP43406 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ItgavP43406 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ItgavP43406 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ItgavP43406 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ItgavP43406 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ItgavP43406 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ItgavP43406 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ItgavP43406 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ItgavP43406 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ItgavP43406 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ItgavP43406 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ItgavP43406 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ItgavP43406 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ItgavP43406 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms