Protein–RNA interactions for Protein: P43135

Nr2f2, COUP transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f2P43135 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nr2f2P43135 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nr2f2P43135 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nr2f2P43135 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nr2f2P43135 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nr2f2P43135 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nr2f2P43135 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nr2f2P43135 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nr2f2P43135 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nr2f2P43135 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nr2f2P43135 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nr2f2P43135 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nr2f2P43135 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nr2f2P43135 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nr2f2P43135 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nr2f2P43135 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nr2f2P43135 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nr2f2P43135 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nr2f2P43135 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nr2f2P43135 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nr2f2P43135 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nr2f2P43135 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nr2f2P43135 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nr2f2P43135 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nr2f2P43135 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nr2f2P43135 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nr2f2P43135 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nr2f2P43135 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nr2f2P43135 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nr2f2P43135 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nr2f2P43135 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nr2f2P43135 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nr2f2P43135 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nr2f2P43135 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nr2f2P43135 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nr2f2P43135 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nr2f2P43135 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nr2f2P43135 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nr2f2P43135 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nr2f2P43135 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nr2f2P43135 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nr2f2P43135 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nr2f2P43135 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nr2f2P43135 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nr2f2P43135 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nr2f2P43135 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nr2f2P43135 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nr2f2P43135 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nr2f2P43135 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nr2f2P43135 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nr2f2P43135 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nr2f2P43135 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nr2f2P43135 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nr2f2P43135 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nr2f2P43135 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nr2f2P43135 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nr2f2P43135 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nr2f2P43135 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nr2f2P43135 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nr2f2P43135 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nr2f2P43135 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nr2f2P43135 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nr2f2P43135 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nr2f2P43135 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nr2f2P43135 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nr2f2P43135 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nr2f2P43135 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nr2f2P43135 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nr2f2P43135 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nr2f2P43135 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nr2f2P43135 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nr2f2P43135 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Nr2f2P43135 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Nr2f2P43135 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nr2f2P43135 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nr2f2P43135 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nr2f2P43135 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nr2f2P43135 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nr2f2P43135 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nr2f2P43135 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nr2f2P43135 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nr2f2P43135 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nr2f2P43135 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nr2f2P43135 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nr2f2P43135 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nr2f2P43135 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nr2f2P43135 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nr2f2P43135 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nr2f2P43135 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nr2f2P43135 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nr2f2P43135 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nr2f2P43135 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nr2f2P43135 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nr2f2P43135 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nr2f2P43135 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nr2f2P43135 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nr2f2P43135 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nr2f2P43135 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nr2f2P43135 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nr2f2P43135 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms