Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gdf5P43027 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gdf5P43027 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gdf5P43027 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gdf5P43027 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gdf5P43027 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gdf5P43027 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gdf5P43027 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gdf5P43027 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Gdf5P43027 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gdf5P43027 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gdf5P43027 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gdf5P43027 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gdf5P43027 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gdf5P43027 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gdf5P43027 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Gdf5P43027 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Gdf5P43027 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gdf5P43027 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gdf5P43027 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gdf5P43027 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gdf5P43027 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gdf5P43027 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gdf5P43027 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gdf5P43027 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gdf5P43027 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gdf5P43027 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gdf5P43027 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gdf5P43027 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gdf5P43027 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gdf5P43027 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gdf5P43027 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gdf5P43027 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gdf5P43027 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gdf5P43027 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gdf5P43027 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gdf5P43027 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gdf5P43027 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gdf5P43027 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gdf5P43027 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gdf5P43027 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gdf5P43027 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gdf5P43027 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gdf5P43027 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gdf5P43027 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Gdf5P43027 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gdf5P43027 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gdf5P43027 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gdf5P43027 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gdf5P43027 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gdf5P43027 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gdf5P43027 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gdf5P43027 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gdf5P43027 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gdf5P43027 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gdf5P43027 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gdf5P43027 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gdf5P43027 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gdf5P43027 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gdf5P43027 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gdf5P43027 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gdf5P43027 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gdf5P43027 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gdf5P43027 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gdf5P43027 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gdf5P43027 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gdf5P43027 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gdf5P43027 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gdf5P43027 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gdf5P43027 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gdf5P43027 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gdf5P43027 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gdf5P43027 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gdf5P43027 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gdf5P43027 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gdf5P43027 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gdf5P43027 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gdf5P43027 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gdf5P43027 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gdf5P43027 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gdf5P43027 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gdf5P43027 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gdf5P43027 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gdf5P43027 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gdf5P43027 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gdf5P43027 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gdf5P43027 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gdf5P43027 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gdf5P43027 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gdf5P43027 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gdf5P43027 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gdf5P43027 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gdf5P43027 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gdf5P43027 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gdf5P43027 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gdf5P43027 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gdf5P43027 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gdf5P43027 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gdf5P43027 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gdf5P43027 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms