Protein–RNA interactions for Protein: P42859

Htt, Huntingtin, mousemouse

Predictions only

Length 3,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HttP42859 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HttP42859 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HttP42859 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HttP42859 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HttP42859 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HttP42859 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HttP42859 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HttP42859 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HttP42859 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HttP42859 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HttP42859 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HttP42859 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HttP42859 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HttP42859 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HttP42859 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HttP42859 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HttP42859 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HttP42859 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HttP42859 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HttP42859 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HttP42859 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HttP42859 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HttP42859 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HttP42859 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HttP42859 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HttP42859 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HttP42859 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HttP42859 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HttP42859 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HttP42859 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HttP42859 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HttP42859 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HttP42859 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HttP42859 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HttP42859 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HttP42859 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HttP42859 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HttP42859 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HttP42859 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HttP42859 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HttP42859 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HttP42859 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HttP42859 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HttP42859 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HttP42859 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HttP42859 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HttP42859 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HttP42859 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HttP42859 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HttP42859 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HttP42859 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HttP42859 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HttP42859 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HttP42859 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HttP42859 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HttP42859 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HttP42859 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HttP42859 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HttP42859 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HttP42859 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HttP42859 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HttP42859 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HttP42859 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HttP42859 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HttP42859 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HttP42859 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HttP42859 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HttP42859 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HttP42859 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HttP42859 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HttP42859 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HttP42859 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HttP42859 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HttP42859 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HttP42859 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HttP42859 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HttP42859 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HttP42859 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HttP42859 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HttP42859 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HttP42859 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HttP42859 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HttP42859 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HttP42859 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HttP42859 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HttP42859 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HttP42859 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HttP42859 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HttP42859 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HttP42859 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HttP42859 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HttP42859 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HttP42859 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HttP42859 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HttP42859 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HttP42859 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HttP42859 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HttP42859 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HttP42859 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HttP42859 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms