Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nkx1-2P42580 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nkx1-2P42580 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nkx1-2P42580 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nkx1-2P42580 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nkx1-2P42580 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nkx1-2P42580 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Nkx1-2P42580 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nkx1-2P42580 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nkx1-2P42580 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nkx1-2P42580 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nkx1-2P42580 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nkx1-2P42580 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nkx1-2P42580 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nkx1-2P42580 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nkx1-2P42580 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nkx1-2P42580 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nkx1-2P42580 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nkx1-2P42580 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nkx1-2P42580 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nkx1-2P42580 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nkx1-2P42580 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nkx1-2P42580 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nkx1-2P42580 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nkx1-2P42580 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nkx1-2P42580 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nkx1-2P42580 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nkx1-2P42580 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nkx1-2P42580 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nkx1-2P42580 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nkx1-2P42580 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nkx1-2P42580 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Nkx1-2P42580 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Nkx1-2P42580 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nkx1-2P42580 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nkx1-2P42580 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nkx1-2P42580 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nkx1-2P42580 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nkx1-2P42580 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nkx1-2P42580 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nkx1-2P42580 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nkx1-2P42580 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nkx1-2P42580 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nkx1-2P42580 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nkx1-2P42580 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nkx1-2P42580 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Nkx1-2P42580 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nkx1-2P42580 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nkx1-2P42580 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nkx1-2P42580 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nkx1-2P42580 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nkx1-2P42580 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nkx1-2P42580 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Nkx1-2P42580 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nkx1-2P42580 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nkx1-2P42580 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nkx1-2P42580 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nkx1-2P42580 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nkx1-2P42580 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nkx1-2P42580 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nkx1-2P42580 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nkx1-2P42580 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nkx1-2P42580 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nkx1-2P42580 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nkx1-2P42580 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nkx1-2P42580 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nkx1-2P42580 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nkx1-2P42580 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nkx1-2P42580 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Nkx1-2P42580 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nkx1-2P42580 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nkx1-2P42580 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nkx1-2P42580 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nkx1-2P42580 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nkx1-2P42580 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nkx1-2P42580 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nkx1-2P42580 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nkx1-2P42580 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nkx1-2P42580 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nkx1-2P42580 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nkx1-2P42580 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Nkx1-2P42580 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nkx1-2P42580 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nkx1-2P42580 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Nkx1-2P42580 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nkx1-2P42580 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nkx1-2P42580 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nkx1-2P42580 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nkx1-2P42580 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nkx1-2P42580 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nkx1-2P42580 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Nkx1-2P42580 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nkx1-2P42580 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Nkx1-2P42580 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nkx1-2P42580 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nkx1-2P42580 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nkx1-2P42580 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nkx1-2P42580 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nkx1-2P42580 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nkx1-2P42580 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms