Protein–RNA interactions for Protein: P41778

Pbx1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbx1P41778 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pbx1P41778 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pbx1P41778 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pbx1P41778 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pbx1P41778 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Pbx1P41778 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pbx1P41778 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pbx1P41778 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pbx1P41778 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pbx1P41778 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pbx1P41778 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pbx1P41778 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pbx1P41778 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pbx1P41778 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pbx1P41778 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pbx1P41778 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pbx1P41778 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pbx1P41778 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pbx1P41778 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pbx1P41778 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pbx1P41778 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pbx1P41778 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pbx1P41778 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pbx1P41778 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pbx1P41778 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pbx1P41778 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pbx1P41778 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pbx1P41778 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pbx1P41778 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pbx1P41778 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pbx1P41778 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pbx1P41778 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pbx1P41778 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pbx1P41778 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pbx1P41778 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pbx1P41778 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pbx1P41778 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pbx1P41778 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pbx1P41778 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pbx1P41778 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pbx1P41778 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pbx1P41778 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pbx1P41778 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pbx1P41778 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pbx1P41778 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pbx1P41778 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pbx1P41778 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pbx1P41778 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pbx1P41778 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pbx1P41778 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pbx1P41778 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pbx1P41778 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pbx1P41778 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pbx1P41778 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pbx1P41778 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pbx1P41778 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pbx1P41778 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pbx1P41778 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pbx1P41778 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pbx1P41778 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pbx1P41778 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pbx1P41778 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pbx1P41778 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pbx1P41778 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pbx1P41778 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pbx1P41778 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pbx1P41778 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pbx1P41778 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pbx1P41778 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pbx1P41778 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pbx1P41778 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pbx1P41778 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pbx1P41778 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pbx1P41778 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pbx1P41778 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pbx1P41778 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pbx1P41778 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pbx1P41778 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pbx1P41778 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pbx1P41778 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pbx1P41778 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Pbx1P41778 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pbx1P41778 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pbx1P41778 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Pbx1P41778 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pbx1P41778 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pbx1P41778 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pbx1P41778 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pbx1P41778 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pbx1P41778 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pbx1P41778 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pbx1P41778 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pbx1P41778 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pbx1P41778 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pbx1P41778 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pbx1P41778 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pbx1P41778 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pbx1P41778 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pbx1P41778 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pbx1P41778 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms