Protein–RNA interactions for Protein: P40240

Cd9, CD9 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd9P40240 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd9P40240 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd9P40240 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd9P40240 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd9P40240 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd9P40240 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd9P40240 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd9P40240 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd9P40240 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd9P40240 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd9P40240 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd9P40240 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd9P40240 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd9P40240 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd9P40240 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd9P40240 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd9P40240 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd9P40240 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd9P40240 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd9P40240 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd9P40240 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd9P40240 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd9P40240 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd9P40240 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd9P40240 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd9P40240 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd9P40240 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd9P40240 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd9P40240 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd9P40240 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd9P40240 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd9P40240 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd9P40240 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd9P40240 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd9P40240 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd9P40240 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd9P40240 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd9P40240 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd9P40240 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd9P40240 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd9P40240 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd9P40240 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd9P40240 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd9P40240 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd9P40240 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd9P40240 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd9P40240 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd9P40240 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd9P40240 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd9P40240 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd9P40240 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd9P40240 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd9P40240 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd9P40240 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd9P40240 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd9P40240 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd9P40240 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd9P40240 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd9P40240 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd9P40240 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd9P40240 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd9P40240 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd9P40240 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd9P40240 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd9P40240 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd9P40240 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd9P40240 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd9P40240 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd9P40240 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd9P40240 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd9P40240 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd9P40240 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd9P40240 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd9P40240 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd9P40240 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd9P40240 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd9P40240 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd9P40240 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd9P40240 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd9P40240 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd9P40240 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd9P40240 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd9P40240 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd9P40240 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd9P40240 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd9P40240 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd9P40240 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd9P40240 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd9P40240 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd9P40240 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd9P40240 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd9P40240 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd9P40240 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd9P40240 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd9P40240 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd9P40240 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd9P40240 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd9P40240 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd9P40240 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd9P40240 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms