Protein–RNA interactions for Protein: P39061

Col18a1, Collagen alpha-1(XVIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col18a1P39061 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Col18a1P39061 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Col18a1P39061 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Col18a1P39061 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Col18a1P39061 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Col18a1P39061 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Col18a1P39061 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Col18a1P39061 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Col18a1P39061 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Col18a1P39061 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Col18a1P39061 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Col18a1P39061 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Col18a1P39061 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Col18a1P39061 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Col18a1P39061 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Col18a1P39061 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Col18a1P39061 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Col18a1P39061 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Col18a1P39061 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Col18a1P39061 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Col18a1P39061 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Col18a1P39061 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Col18a1P39061 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Col18a1P39061 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Col18a1P39061 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Col18a1P39061 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Col18a1P39061 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Col18a1P39061 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Col18a1P39061 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Col18a1P39061 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Col18a1P39061 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Col18a1P39061 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Col18a1P39061 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Col18a1P39061 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Col18a1P39061 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Col18a1P39061 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Col18a1P39061 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Col18a1P39061 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Col18a1P39061 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Col18a1P39061 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Col18a1P39061 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Col18a1P39061 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Col18a1P39061 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Col18a1P39061 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Col18a1P39061 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Col18a1P39061 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Col18a1P39061 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Col18a1P39061 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Col18a1P39061 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Col18a1P39061 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Col18a1P39061 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Col18a1P39061 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Col18a1P39061 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Col18a1P39061 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Col18a1P39061 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Col18a1P39061 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Col18a1P39061 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Col18a1P39061 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Col18a1P39061 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Col18a1P39061 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Col18a1P39061 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Col18a1P39061 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Col18a1P39061 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Col18a1P39061 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Col18a1P39061 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Col18a1P39061 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Col18a1P39061 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Col18a1P39061 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Col18a1P39061 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Col18a1P39061 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Col18a1P39061 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Col18a1P39061 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Col18a1P39061 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Col18a1P39061 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Col18a1P39061 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Col18a1P39061 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Col18a1P39061 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Col18a1P39061 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Col18a1P39061 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Col18a1P39061 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Col18a1P39061 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Col18a1P39061 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Col18a1P39061 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Col18a1P39061 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Col18a1P39061 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Col18a1P39061 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Col18a1P39061 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Col18a1P39061 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Col18a1P39061 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Col18a1P39061 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Col18a1P39061 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Col18a1P39061 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Col18a1P39061 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Col18a1P39061 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Col18a1P39061 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Col18a1P39061 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Col18a1P39061 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Col18a1P39061 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Col18a1P39061 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Col18a1P39061 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms