Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lig1P37913 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lig1P37913 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Lig1P37913 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lig1P37913 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lig1P37913 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lig1P37913 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lig1P37913 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lig1P37913 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lig1P37913 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lig1P37913 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lig1P37913 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lig1P37913 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lig1P37913 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lig1P37913 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Lig1P37913 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Lig1P37913 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lig1P37913 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lig1P37913 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lig1P37913 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lig1P37913 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lig1P37913 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Lig1P37913 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lig1P37913 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lig1P37913 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lig1P37913 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lig1P37913 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lig1P37913 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lig1P37913 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lig1P37913 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lig1P37913 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lig1P37913 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Lig1P37913 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lig1P37913 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lig1P37913 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lig1P37913 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lig1P37913 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lig1P37913 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lig1P37913 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lig1P37913 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lig1P37913 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lig1P37913 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lig1P37913 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lig1P37913 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lig1P37913 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Lig1P37913 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lig1P37913 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lig1P37913 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lig1P37913 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lig1P37913 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lig1P37913 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lig1P37913 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lig1P37913 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lig1P37913 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lig1P37913 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lig1P37913 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lig1P37913 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lig1P37913 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lig1P37913 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lig1P37913 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lig1P37913 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lig1P37913 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lig1P37913 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lig1P37913 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lig1P37913 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lig1P37913 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lig1P37913 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lig1P37913 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lig1P37913 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lig1P37913 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lig1P37913 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lig1P37913 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Lig1P37913 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lig1P37913 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lig1P37913 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lig1P37913 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lig1P37913 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lig1P37913 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lig1P37913 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Lig1P37913 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Lig1P37913 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lig1P37913 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lig1P37913 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lig1P37913 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lig1P37913 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lig1P37913 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lig1P37913 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lig1P37913 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lig1P37913 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lig1P37913 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lig1P37913 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lig1P37913 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Lig1P37913 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lig1P37913 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lig1P37913 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lig1P37913 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lig1P37913 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lig1P37913 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lig1P37913 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lig1P37913 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms