Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ddit3P35639 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ddit3P35639 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ddit3P35639 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ddit3P35639 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ddit3P35639 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ddit3P35639 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ddit3P35639 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ddit3P35639 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ddit3P35639 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ddit3P35639 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ddit3P35639 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ddit3P35639 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ddit3P35639 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ddit3P35639 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ddit3P35639 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ddit3P35639 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ddit3P35639 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ddit3P35639 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ddit3P35639 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ddit3P35639 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddit3P35639 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddit3P35639 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddit3P35639 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddit3P35639 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddit3P35639 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddit3P35639 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddit3P35639 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddit3P35639 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddit3P35639 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddit3P35639 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ddit3P35639 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ddit3P35639 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ddit3P35639 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ddit3P35639 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ddit3P35639 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ddit3P35639 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ddit3P35639 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ddit3P35639 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ddit3P35639 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ddit3P35639 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ddit3P35639 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ddit3P35639 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ddit3P35639 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ddit3P35639 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ddit3P35639 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ddit3P35639 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ddit3P35639 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ddit3P35639 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ddit3P35639 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ddit3P35639 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ddit3P35639 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ddit3P35639 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ddit3P35639 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ddit3P35639 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ddit3P35639 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ddit3P35639 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ddit3P35639 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ddit3P35639 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddit3P35639 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddit3P35639 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddit3P35639 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddit3P35639 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddit3P35639 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddit3P35639 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddit3P35639 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddit3P35639 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddit3P35639 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddit3P35639 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddit3P35639 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ddit3P35639 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ddit3P35639 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ddit3P35639 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ddit3P35639 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ddit3P35639 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ddit3P35639 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ddit3P35639 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ddit3P35639 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ddit3P35639 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ddit3P35639 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ddit3P35639 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ddit3P35639 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ddit3P35639 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddit3P35639 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddit3P35639 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddit3P35639 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddit3P35639 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddit3P35639 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddit3P35639 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddit3P35639 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddit3P35639 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddit3P35639 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddit3P35639 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddit3P35639 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddit3P35639 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddit3P35639 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddit3P35639 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddit3P35639 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddit3P35639 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddit3P35639 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms