Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Grin1P35438 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Grin1P35438 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Grin1P35438 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Grin1P35438 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Grin1P35438 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Grin1P35438 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Grin1P35438 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Grin1P35438 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Grin1P35438 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Grin1P35438 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Grin1P35438 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Grin1P35438 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Grin1P35438 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Grin1P35438 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Grin1P35438 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Grin1P35438 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Grin1P35438 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Grin1P35438 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Grin1P35438 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Grin1P35438 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Grin1P35438 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Grin1P35438 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Grin1P35438 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Grin1P35438 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Grin1P35438 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Grin1P35438 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Grin1P35438 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Grin1P35438 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Grin1P35438 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Grin1P35438 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Grin1P35438 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Grin1P35438 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Grin1P35438 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Grin1P35438 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Grin1P35438 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Grin1P35438 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Grin1P35438 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Grin1P35438 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Grin1P35438 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Grin1P35438 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Grin1P35438 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Grin1P35438 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Grin1P35438 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Grin1P35438 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Grin1P35438 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Grin1P35438 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Grin1P35438 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Grin1P35438 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Grin1P35438 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Grin1P35438 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Grin1P35438 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Grin1P35438 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Grin1P35438 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Grin1P35438 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Grin1P35438 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Grin1P35438 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Grin1P35438 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Grin1P35438 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Grin1P35438 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Grin1P35438 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Grin1P35438 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Grin1P35438 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Grin1P35438 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Grin1P35438 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Grin1P35438 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Grin1P35438 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Grin1P35438 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Grin1P35438 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Grin1P35438 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Grin1P35438 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Grin1P35438 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Grin1P35438 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Grin1P35438 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Grin1P35438 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Grin1P35438 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grin1P35438 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grin1P35438 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grin1P35438 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grin1P35438 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grin1P35438 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grin1P35438 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grin1P35438 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grin1P35438 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grin1P35438 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grin1P35438 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Grin1P35438 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Grin1P35438 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Grin1P35438 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Grin1P35438 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Grin1P35438 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Grin1P35438 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Grin1P35438 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Grin1P35438 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Grin1P35438 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Grin1P35438 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Grin1P35438 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Grin1P35438 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Grin1P35438 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Grin1P35438 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms