Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptpn11P35235 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptpn11P35235 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptpn11P35235 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptpn11P35235 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptpn11P35235 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptpn11P35235 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptpn11P35235 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptpn11P35235 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptpn11P35235 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptpn11P35235 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptpn11P35235 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptpn11P35235 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptpn11P35235 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptpn11P35235 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptpn11P35235 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptpn11P35235 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptpn11P35235 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptpn11P35235 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptpn11P35235 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptpn11P35235 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptpn11P35235 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptpn11P35235 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptpn11P35235 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptpn11P35235 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptpn11P35235 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptpn11P35235 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptpn11P35235 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptpn11P35235 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptpn11P35235 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptpn11P35235 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptpn11P35235 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptpn11P35235 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptpn11P35235 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptpn11P35235 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptpn11P35235 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptpn11P35235 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptpn11P35235 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptpn11P35235 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptpn11P35235 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptpn11P35235 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptpn11P35235 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptpn11P35235 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptpn11P35235 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptpn11P35235 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptpn11P35235 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptpn11P35235 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ptpn11P35235 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptpn11P35235 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptpn11P35235 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptpn11P35235 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptpn11P35235 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptpn11P35235 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptpn11P35235 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptpn11P35235 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptpn11P35235 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptpn11P35235 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptpn11P35235 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptpn11P35235 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptpn11P35235 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptpn11P35235 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptpn11P35235 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptpn11P35235 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptpn11P35235 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptpn11P35235 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptpn11P35235 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpn11P35235 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpn11P35235 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpn11P35235 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpn11P35235 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpn11P35235 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpn11P35235 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpn11P35235 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpn11P35235 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpn11P35235 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpn11P35235 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpn11P35235 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptpn11P35235 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptpn11P35235 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptpn11P35235 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptpn11P35235 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptpn11P35235 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptpn11P35235 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptpn11P35235 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptpn11P35235 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptpn11P35235 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptpn11P35235 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptpn11P35235 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptpn11P35235 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpn11P35235 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpn11P35235 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpn11P35235 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpn11P35235 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpn11P35235 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpn11P35235 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpn11P35235 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpn11P35235 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpn11P35235 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpn11P35235 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpn11P35235 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms