Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp4P35123 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp4P35123 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp4P35123 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp4P35123 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp4P35123 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp4P35123 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp4P35123 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp4P35123 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp4P35123 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp4P35123 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp4P35123 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp4P35123 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp4P35123 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp4P35123 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp4P35123 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp4P35123 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp4P35123 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp4P35123 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp4P35123 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp4P35123 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp4P35123 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp4P35123 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp4P35123 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp4P35123 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp4P35123 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp4P35123 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp4P35123 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp4P35123 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp4P35123 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp4P35123 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp4P35123 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp4P35123 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp4P35123 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp4P35123 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp4P35123 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp4P35123 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp4P35123 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp4P35123 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp4P35123 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp4P35123 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp4P35123 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp4P35123 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp4P35123 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp4P35123 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp4P35123 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp4P35123 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp4P35123 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp4P35123 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp4P35123 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp4P35123 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp4P35123 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp4P35123 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Usp4P35123 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Usp4P35123 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp4P35123 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp4P35123 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp4P35123 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp4P35123 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp4P35123 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp4P35123 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp4P35123 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp4P35123 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp4P35123 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp4P35123 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp4P35123 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp4P35123 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp4P35123 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp4P35123 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp4P35123 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp4P35123 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp4P35123 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp4P35123 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp4P35123 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp4P35123 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp4P35123 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp4P35123 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp4P35123 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp4P35123 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp4P35123 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp4P35123 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp4P35123 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp4P35123 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp4P35123 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp4P35123 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp4P35123 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp4P35123 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp4P35123 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp4P35123 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp4P35123 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp4P35123 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp4P35123 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp4P35123 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp4P35123 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp4P35123 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp4P35123 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp4P35123 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp4P35123 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp4P35123 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp4P35123 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.7 ms