Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdh15P33146 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdh15P33146 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdh15P33146 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdh15P33146 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdh15P33146 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdh15P33146 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdh15P33146 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdh15P33146 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdh15P33146 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cdh15P33146 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cdh15P33146 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cdh15P33146 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdh15P33146 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdh15P33146 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdh15P33146 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdh15P33146 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdh15P33146 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdh15P33146 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdh15P33146 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdh15P33146 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdh15P33146 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdh15P33146 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdh15P33146 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdh15P33146 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdh15P33146 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdh15P33146 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdh15P33146 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdh15P33146 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdh15P33146 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdh15P33146 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdh15P33146 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdh15P33146 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdh15P33146 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdh15P33146 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdh15P33146 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdh15P33146 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdh15P33146 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdh15P33146 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdh15P33146 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdh15P33146 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdh15P33146 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdh15P33146 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdh15P33146 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdh15P33146 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdh15P33146 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdh15P33146 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdh15P33146 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdh15P33146 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdh15P33146 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdh15P33146 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdh15P33146 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdh15P33146 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdh15P33146 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdh15P33146 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdh15P33146 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdh15P33146 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdh15P33146 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cdh15P33146 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cdh15P33146 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdh15P33146 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdh15P33146 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdh15P33146 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdh15P33146 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdh15P33146 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdh15P33146 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdh15P33146 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdh15P33146 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdh15P33146 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdh15P33146 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdh15P33146 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdh15P33146 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdh15P33146 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdh15P33146 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdh15P33146 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdh15P33146 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdh15P33146 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdh15P33146 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdh15P33146 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdh15P33146 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdh15P33146 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdh15P33146 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdh15P33146 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdh15P33146 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdh15P33146 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdh15P33146 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdh15P33146 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdh15P33146 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdh15P33146 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdh15P33146 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdh15P33146 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdh15P33146 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdh15P33146 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdh15P33146 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdh15P33146 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdh15P33146 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdh15P33146 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdh15P33146 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdh15P33146 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdh15P33146 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms