Protein–RNA interactions for Protein: P32020

Scp2, Non-specific lipid-transfer protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scp2P32020 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scp2P32020 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scp2P32020 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scp2P32020 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Scp2P32020 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scp2P32020 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scp2P32020 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scp2P32020 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scp2P32020 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scp2P32020 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scp2P32020 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scp2P32020 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scp2P32020 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scp2P32020 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scp2P32020 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scp2P32020 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scp2P32020 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scp2P32020 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scp2P32020 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scp2P32020 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scp2P32020 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scp2P32020 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scp2P32020 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scp2P32020 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scp2P32020 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scp2P32020 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scp2P32020 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scp2P32020 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scp2P32020 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scp2P32020 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scp2P32020 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scp2P32020 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scp2P32020 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scp2P32020 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scp2P32020 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scp2P32020 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scp2P32020 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scp2P32020 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scp2P32020 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scp2P32020 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scp2P32020 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scp2P32020 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scp2P32020 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scp2P32020 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scp2P32020 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scp2P32020 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scp2P32020 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scp2P32020 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Scp2P32020 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scp2P32020 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scp2P32020 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scp2P32020 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scp2P32020 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scp2P32020 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scp2P32020 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scp2P32020 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scp2P32020 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Scp2P32020 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scp2P32020 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scp2P32020 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scp2P32020 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scp2P32020 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scp2P32020 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scp2P32020 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Scp2P32020 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scp2P32020 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scp2P32020 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scp2P32020 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scp2P32020 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scp2P32020 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scp2P32020 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scp2P32020 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scp2P32020 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scp2P32020 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scp2P32020 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scp2P32020 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scp2P32020 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scp2P32020 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scp2P32020 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scp2P32020 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scp2P32020 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scp2P32020 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Scp2P32020 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Scp2P32020 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scp2P32020 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scp2P32020 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scp2P32020 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scp2P32020 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scp2P32020 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scp2P32020 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scp2P32020 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scp2P32020 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scp2P32020 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Scp2P32020 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Scp2P32020 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Scp2P32020 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scp2P32020 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scp2P32020 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scp2P32020 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Scp2P32020 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms