Protein–RNA interactions for Protein: P30658

Cbx2, Chromobox protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx2P30658 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cbx2P30658 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cbx2P30658 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cbx2P30658 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cbx2P30658 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cbx2P30658 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cbx2P30658 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cbx2P30658 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cbx2P30658 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cbx2P30658 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cbx2P30658 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cbx2P30658 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cbx2P30658 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cbx2P30658 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cbx2P30658 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cbx2P30658 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cbx2P30658 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cbx2P30658 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cbx2P30658 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cbx2P30658 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cbx2P30658 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cbx2P30658 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cbx2P30658 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cbx2P30658 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cbx2P30658 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cbx2P30658 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cbx2P30658 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cbx2P30658 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cbx2P30658 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cbx2P30658 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cbx2P30658 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cbx2P30658 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cbx2P30658 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cbx2P30658 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cbx2P30658 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cbx2P30658 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cbx2P30658 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cbx2P30658 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cbx2P30658 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cbx2P30658 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cbx2P30658 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cbx2P30658 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cbx2P30658 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cbx2P30658 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cbx2P30658 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cbx2P30658 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cbx2P30658 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cbx2P30658 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cbx2P30658 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cbx2P30658 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cbx2P30658 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cbx2P30658 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cbx2P30658 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cbx2P30658 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cbx2P30658 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cbx2P30658 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cbx2P30658 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cbx2P30658 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cbx2P30658 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cbx2P30658 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cbx2P30658 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cbx2P30658 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cbx2P30658 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cbx2P30658 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cbx2P30658 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cbx2P30658 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cbx2P30658 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cbx2P30658 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cbx2P30658 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cbx2P30658 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cbx2P30658 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cbx2P30658 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cbx2P30658 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cbx2P30658 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cbx2P30658 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cbx2P30658 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cbx2P30658 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cbx2P30658 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cbx2P30658 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cbx2P30658 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cbx2P30658 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cbx2P30658 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cbx2P30658 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cbx2P30658 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cbx2P30658 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cbx2P30658 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cbx2P30658 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cbx2P30658 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cbx2P30658 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cbx2P30658 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cbx2P30658 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cbx2P30658 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cbx2P30658 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cbx2P30658 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cbx2P30658 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cbx2P30658 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cbx2P30658 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cbx2P30658 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cbx2P30658 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cbx2P30658 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms