Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VtnP29788 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VtnP29788 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VtnP29788 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VtnP29788 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VtnP29788 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
VtnP29788 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
VtnP29788 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VtnP29788 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VtnP29788 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VtnP29788 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VtnP29788 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VtnP29788 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VtnP29788 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VtnP29788 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
VtnP29788 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VtnP29788 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VtnP29788 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VtnP29788 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VtnP29788 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VtnP29788 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VtnP29788 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VtnP29788 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VtnP29788 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VtnP29788 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VtnP29788 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VtnP29788 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
VtnP29788 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VtnP29788 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VtnP29788 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VtnP29788 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VtnP29788 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VtnP29788 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VtnP29788 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VtnP29788 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VtnP29788 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VtnP29788 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VtnP29788 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VtnP29788 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
VtnP29788 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VtnP29788 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VtnP29788 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VtnP29788 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VtnP29788 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VtnP29788 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VtnP29788 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VtnP29788 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
VtnP29788 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VtnP29788 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VtnP29788 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VtnP29788 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VtnP29788 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VtnP29788 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VtnP29788 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VtnP29788 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VtnP29788 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VtnP29788 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VtnP29788 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VtnP29788 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VtnP29788 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VtnP29788 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VtnP29788 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VtnP29788 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VtnP29788 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VtnP29788 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VtnP29788 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VtnP29788 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VtnP29788 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
VtnP29788 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
VtnP29788 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VtnP29788 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
VtnP29788 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VtnP29788 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VtnP29788 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
VtnP29788 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VtnP29788 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VtnP29788 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VtnP29788 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VtnP29788 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VtnP29788 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VtnP29788 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VtnP29788 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VtnP29788 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
VtnP29788 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VtnP29788 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VtnP29788 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VtnP29788 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VtnP29788 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VtnP29788 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VtnP29788 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VtnP29788 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VtnP29788 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
VtnP29788 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VtnP29788 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VtnP29788 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VtnP29788 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VtnP29788 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VtnP29788 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VtnP29788 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VtnP29788 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms