Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkcdP28867 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkcdP28867 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkcdP28867 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkcdP28867 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkcdP28867 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkcdP28867 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkcdP28867 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkcdP28867 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkcdP28867 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkcdP28867 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkcdP28867 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkcdP28867 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkcdP28867 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkcdP28867 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkcdP28867 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkcdP28867 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkcdP28867 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkcdP28867 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkcdP28867 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkcdP28867 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkcdP28867 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkcdP28867 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkcdP28867 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkcdP28867 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkcdP28867 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkcdP28867 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkcdP28867 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkcdP28867 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkcdP28867 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrkcdP28867 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms