Protein–RNA interactions for Protein: P28667

Marcksl1, MARCKS-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Marcksl1P28667 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Marcksl1P28667 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Marcksl1P28667 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Marcksl1P28667 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Marcksl1P28667 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Marcksl1P28667 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Marcksl1P28667 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Marcksl1P28667 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Marcksl1P28667 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Marcksl1P28667 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Marcksl1P28667 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Marcksl1P28667 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Marcksl1P28667 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Marcksl1P28667 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Marcksl1P28667 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Marcksl1P28667 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Marcksl1P28667 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Marcksl1P28667 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Marcksl1P28667 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Marcksl1P28667 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Marcksl1P28667 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Marcksl1P28667 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Marcksl1P28667 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Marcksl1P28667 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Marcksl1P28667 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Marcksl1P28667 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Marcksl1P28667 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Marcksl1P28667 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Marcksl1P28667 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Marcksl1P28667 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Marcksl1P28667 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Marcksl1P28667 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Marcksl1P28667 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Marcksl1P28667 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Marcksl1P28667 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Marcksl1P28667 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Marcksl1P28667 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Marcksl1P28667 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Marcksl1P28667 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Marcksl1P28667 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Marcksl1P28667 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Marcksl1P28667 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Marcksl1P28667 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Marcksl1P28667 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Marcksl1P28667 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Marcksl1P28667 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Marcksl1P28667 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Marcksl1P28667 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Marcksl1P28667 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Marcksl1P28667 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Marcksl1P28667 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Marcksl1P28667 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Marcksl1P28667 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Marcksl1P28667 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Marcksl1P28667 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Marcksl1P28667 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Marcksl1P28667 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Marcksl1P28667 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Marcksl1P28667 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Marcksl1P28667 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Marcksl1P28667 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Marcksl1P28667 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Marcksl1P28667 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Marcksl1P28667 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Marcksl1P28667 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Marcksl1P28667 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Marcksl1P28667 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Marcksl1P28667 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Marcksl1P28667 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Marcksl1P28667 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Marcksl1P28667 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Marcksl1P28667 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Marcksl1P28667 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Marcksl1P28667 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Marcksl1P28667 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Marcksl1P28667 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Marcksl1P28667 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Marcksl1P28667 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Marcksl1P28667 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Marcksl1P28667 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Marcksl1P28667 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Marcksl1P28667 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Marcksl1P28667 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Marcksl1P28667 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Marcksl1P28667 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Marcksl1P28667 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Marcksl1P28667 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Marcksl1P28667 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Marcksl1P28667 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Marcksl1P28667 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Marcksl1P28667 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Marcksl1P28667 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Marcksl1P28667 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Marcksl1P28667 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Marcksl1P28667 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Marcksl1P28667 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Marcksl1P28667 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Marcksl1P28667 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Marcksl1P28667 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Marcksl1P28667 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms