Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Etv4P28322 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Etv4P28322 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Etv4P28322 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Etv4P28322 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Etv4P28322 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Etv4P28322 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Etv4P28322 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Etv4P28322 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Etv4P28322 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Etv4P28322 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Etv4P28322 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Etv4P28322 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Etv4P28322 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Etv4P28322 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Etv4P28322 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Etv4P28322 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Etv4P28322 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Etv4P28322 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Etv4P28322 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Etv4P28322 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Etv4P28322 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Etv4P28322 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Etv4P28322 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Etv4P28322 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Etv4P28322 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Etv4P28322 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Etv4P28322 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Etv4P28322 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Etv4P28322 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Etv4P28322 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Etv4P28322 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Etv4P28322 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Etv4P28322 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Etv4P28322 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Etv4P28322 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Etv4P28322 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Etv4P28322 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Etv4P28322 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Etv4P28322 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Etv4P28322 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Etv4P28322 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Etv4P28322 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Etv4P28322 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Etv4P28322 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Etv4P28322 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Etv4P28322 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Etv4P28322 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Etv4P28322 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Etv4P28322 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Etv4P28322 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Etv4P28322 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Etv4P28322 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Etv4P28322 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Etv4P28322 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Etv4P28322 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Etv4P28322 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Etv4P28322 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Etv4P28322 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Etv4P28322 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Etv4P28322 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Etv4P28322 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Etv4P28322 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Etv4P28322 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Etv4P28322 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Etv4P28322 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Etv4P28322 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Etv4P28322 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Etv4P28322 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Etv4P28322 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Etv4P28322 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Etv4P28322 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Etv4P28322 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Etv4P28322 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Etv4P28322 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Etv4P28322 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Etv4P28322 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Etv4P28322 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Etv4P28322 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Etv4P28322 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Etv4P28322 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Etv4P28322 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Etv4P28322 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Etv4P28322 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Etv4P28322 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Etv4P28322 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Etv4P28322 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Etv4P28322 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Etv4P28322 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Etv4P28322 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Etv4P28322 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Etv4P28322 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Etv4P28322 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Etv4P28322 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Etv4P28322 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Etv4P28322 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Etv4P28322 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Etv4P28322 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Etv4P28322 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Etv4P28322 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms