Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-DMaP28078 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-DMaP28078 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-DMaP28078 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-DMaP28078 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-DMaP28078 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-DMaP28078 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-DMaP28078 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-DMaP28078 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-DMaP28078 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-DMaP28078 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-DMaP28078 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-DMaP28078 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-DMaP28078 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2-DMaP28078 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-DMaP28078 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms