Protein–RNA interactions for Protein: P27808

Mgat1, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 2-beta-N-acetylglucosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgat1P27808 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mgat1P27808 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mgat1P27808 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mgat1P27808 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mgat1P27808 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mgat1P27808 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mgat1P27808 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mgat1P27808 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mgat1P27808 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mgat1P27808 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mgat1P27808 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Mgat1P27808 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mgat1P27808 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mgat1P27808 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mgat1P27808 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mgat1P27808 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mgat1P27808 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mgat1P27808 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mgat1P27808 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mgat1P27808 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mgat1P27808 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mgat1P27808 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mgat1P27808 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mgat1P27808 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mgat1P27808 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mgat1P27808 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mgat1P27808 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mgat1P27808 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mgat1P27808 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mgat1P27808 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mgat1P27808 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mgat1P27808 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mgat1P27808 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mgat1P27808 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mgat1P27808 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mgat1P27808 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mgat1P27808 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mgat1P27808 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mgat1P27808 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mgat1P27808 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mgat1P27808 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mgat1P27808 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mgat1P27808 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mgat1P27808 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mgat1P27808 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mgat1P27808 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mgat1P27808 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mgat1P27808 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mgat1P27808 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mgat1P27808 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mgat1P27808 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mgat1P27808 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mgat1P27808 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mgat1P27808 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mgat1P27808 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mgat1P27808 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mgat1P27808 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mgat1P27808 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mgat1P27808 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Mgat1P27808 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mgat1P27808 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mgat1P27808 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mgat1P27808 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mgat1P27808 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mgat1P27808 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mgat1P27808 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mgat1P27808 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mgat1P27808 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mgat1P27808 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mgat1P27808 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mgat1P27808 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mgat1P27808 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mgat1P27808 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mgat1P27808 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mgat1P27808 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Mgat1P27808 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mgat1P27808 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mgat1P27808 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mgat1P27808 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mgat1P27808 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mgat1P27808 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mgat1P27808 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mgat1P27808 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mgat1P27808 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mgat1P27808 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mgat1P27808 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mgat1P27808 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mgat1P27808 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mgat1P27808 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mgat1P27808 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mgat1P27808 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Mgat1P27808 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mgat1P27808 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mgat1P27808 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Mgat1P27808 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mgat1P27808 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mgat1P27808 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mgat1P27808 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mgat1P27808 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mgat1P27808 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms