Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CenpbP27790 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CenpbP27790 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CenpbP27790 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CenpbP27790 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CenpbP27790 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CenpbP27790 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CenpbP27790 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CenpbP27790 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CenpbP27790 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CenpbP27790 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CenpbP27790 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CenpbP27790 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CenpbP27790 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CenpbP27790 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CenpbP27790 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CenpbP27790 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CenpbP27790 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CenpbP27790 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CenpbP27790 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CenpbP27790 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CenpbP27790 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CenpbP27790 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CenpbP27790 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CenpbP27790 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CenpbP27790 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CenpbP27790 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CenpbP27790 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CenpbP27790 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CenpbP27790 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CenpbP27790 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CenpbP27790 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CenpbP27790 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CenpbP27790 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CenpbP27790 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CenpbP27790 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CenpbP27790 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CenpbP27790 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CenpbP27790 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CenpbP27790 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CenpbP27790 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CenpbP27790 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CenpbP27790 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CenpbP27790 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CenpbP27790 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CenpbP27790 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CenpbP27790 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CenpbP27790 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CenpbP27790 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CenpbP27790 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CenpbP27790 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CenpbP27790 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CenpbP27790 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CenpbP27790 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CenpbP27790 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CenpbP27790 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CenpbP27790 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CenpbP27790 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CenpbP27790 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CenpbP27790 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CenpbP27790 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CenpbP27790 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CenpbP27790 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CenpbP27790 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CenpbP27790 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CenpbP27790 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CenpbP27790 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CenpbP27790 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CenpbP27790 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CenpbP27790 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CenpbP27790 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CenpbP27790 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CenpbP27790 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CenpbP27790 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CenpbP27790 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CenpbP27790 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CenpbP27790 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CenpbP27790 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CenpbP27790 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CenpbP27790 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CenpbP27790 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CenpbP27790 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CenpbP27790 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CenpbP27790 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CenpbP27790 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CenpbP27790 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CenpbP27790 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CenpbP27790 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CenpbP27790 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CenpbP27790 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CenpbP27790 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CenpbP27790 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CenpbP27790 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CenpbP27790 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CenpbP27790 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CenpbP27790 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CenpbP27790 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CenpbP27790 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CenpbP27790 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CenpbP27790 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms