Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pde6aP27664 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pde6aP27664 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pde6aP27664 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pde6aP27664 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pde6aP27664 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pde6aP27664 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pde6aP27664 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pde6aP27664 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pde6aP27664 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pde6aP27664 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pde6aP27664 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pde6aP27664 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pde6aP27664 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pde6aP27664 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pde6aP27664 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pde6aP27664 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pde6aP27664 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pde6aP27664 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pde6aP27664 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pde6aP27664 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pde6aP27664 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pde6aP27664 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pde6aP27664 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pde6aP27664 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pde6aP27664 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pde6aP27664 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pde6aP27664 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pde6aP27664 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pde6aP27664 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pde6aP27664 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pde6aP27664 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pde6aP27664 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pde6aP27664 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pde6aP27664 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pde6aP27664 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pde6aP27664 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pde6aP27664 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Pde6aP27664 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pde6aP27664 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pde6aP27664 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pde6aP27664 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pde6aP27664 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pde6aP27664 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pde6aP27664 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Pde6aP27664 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pde6aP27664 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pde6aP27664 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pde6aP27664 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pde6aP27664 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pde6aP27664 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pde6aP27664 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pde6aP27664 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pde6aP27664 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pde6aP27664 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pde6aP27664 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pde6aP27664 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pde6aP27664 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pde6aP27664 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pde6aP27664 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pde6aP27664 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pde6aP27664 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pde6aP27664 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pde6aP27664 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pde6aP27664 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pde6aP27664 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pde6aP27664 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pde6aP27664 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pde6aP27664 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pde6aP27664 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pde6aP27664 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pde6aP27664 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pde6aP27664 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pde6aP27664 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pde6aP27664 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pde6aP27664 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pde6aP27664 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pde6aP27664 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pde6aP27664 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pde6aP27664 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pde6aP27664 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pde6aP27664 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pde6aP27664 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pde6aP27664 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Pde6aP27664 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pde6aP27664 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pde6aP27664 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pde6aP27664 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pde6aP27664 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pde6aP27664 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pde6aP27664 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pde6aP27664 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pde6aP27664 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pde6aP27664 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pde6aP27664 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pde6aP27664 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pde6aP27664 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pde6aP27664 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pde6aP27664 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pde6aP27664 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms