Protein–RNA interactions for Protein: P27090

Tgfb2, Transforming growth factor beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb2P27090 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tgfb2P27090 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tgfb2P27090 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tgfb2P27090 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tgfb2P27090 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tgfb2P27090 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tgfb2P27090 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Tgfb2P27090 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tgfb2P27090 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tgfb2P27090 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tgfb2P27090 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tgfb2P27090 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Tgfb2P27090 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tgfb2P27090 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tgfb2P27090 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tgfb2P27090 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tgfb2P27090 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tgfb2P27090 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Tgfb2P27090 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tgfb2P27090 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Tgfb2P27090 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tgfb2P27090 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tgfb2P27090 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tgfb2P27090 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tgfb2P27090 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tgfb2P27090 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tgfb2P27090 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tgfb2P27090 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tgfb2P27090 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tgfb2P27090 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tgfb2P27090 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tgfb2P27090 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tgfb2P27090 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tgfb2P27090 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tgfb2P27090 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tgfb2P27090 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Tgfb2P27090 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tgfb2P27090 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tgfb2P27090 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tgfb2P27090 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tgfb2P27090 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tgfb2P27090 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Tgfb2P27090 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tgfb2P27090 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tgfb2P27090 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tgfb2P27090 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tgfb2P27090 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tgfb2P27090 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tgfb2P27090 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Tgfb2P27090 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tgfb2P27090 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tgfb2P27090 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tgfb2P27090 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tgfb2P27090 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tgfb2P27090 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tgfb2P27090 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tgfb2P27090 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tgfb2P27090 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tgfb2P27090 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tgfb2P27090 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tgfb2P27090 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tgfb2P27090 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tgfb2P27090 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tgfb2P27090 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tgfb2P27090 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tgfb2P27090 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Tgfb2P27090 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tgfb2P27090 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tgfb2P27090 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Tgfb2P27090 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tgfb2P27090 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tgfb2P27090 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tgfb2P27090 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tgfb2P27090 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tgfb2P27090 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tgfb2P27090 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tgfb2P27090 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tgfb2P27090 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Tgfb2P27090 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Tgfb2P27090 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tgfb2P27090 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tgfb2P27090 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tgfb2P27090 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tgfb2P27090 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Tgfb2P27090 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tgfb2P27090 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tgfb2P27090 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tgfb2P27090 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tgfb2P27090 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tgfb2P27090 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tgfb2P27090 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tgfb2P27090 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tgfb2P27090 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tgfb2P27090 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tgfb2P27090 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tgfb2P27090 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tgfb2P27090 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tgfb2P27090 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tgfb2P27090 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tgfb2P27090 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms