Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CftrP26361 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CftrP26361 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CftrP26361 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CftrP26361 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CftrP26361 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CftrP26361 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CftrP26361 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CftrP26361 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CftrP26361 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CftrP26361 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CftrP26361 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CftrP26361 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CftrP26361 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CftrP26361 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
CftrP26361 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CftrP26361 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CftrP26361 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CftrP26361 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CftrP26361 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CftrP26361 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CftrP26361 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CftrP26361 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CftrP26361 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CftrP26361 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CftrP26361 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CftrP26361 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CftrP26361 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CftrP26361 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CftrP26361 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CftrP26361 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CftrP26361 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
CftrP26361 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CftrP26361 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CftrP26361 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CftrP26361 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CftrP26361 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CftrP26361 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
CftrP26361 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CftrP26361 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CftrP26361 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CftrP26361 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CftrP26361 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CftrP26361 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CftrP26361 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CftrP26361 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CftrP26361 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
CftrP26361 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
CftrP26361 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CftrP26361 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CftrP26361 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CftrP26361 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CftrP26361 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CftrP26361 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CftrP26361 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
CftrP26361 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
CftrP26361 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
CftrP26361 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
CftrP26361 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
CftrP26361 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CftrP26361 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CftrP26361 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CftrP26361 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CftrP26361 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CftrP26361 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CftrP26361 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CftrP26361 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CftrP26361 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CftrP26361 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CftrP26361 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CftrP26361 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CftrP26361 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CftrP26361 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CftrP26361 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CftrP26361 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CftrP26361 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CftrP26361 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CftrP26361 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CftrP26361 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CftrP26361 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CftrP26361 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CftrP26361 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.23
CftrP26361 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CftrP26361 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CftrP26361 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CftrP26361 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CftrP26361 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CftrP26361 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CftrP26361 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CftrP26361 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CftrP26361 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CftrP26361 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CftrP26361 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CftrP26361 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CftrP26361 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CftrP26361 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CftrP26361 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CftrP26361 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
CftrP26361 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CftrP26361 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms