Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NdnP25233 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NdnP25233 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NdnP25233 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NdnP25233 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NdnP25233 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NdnP25233 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NdnP25233 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NdnP25233 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NdnP25233 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NdnP25233 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NdnP25233 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NdnP25233 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NdnP25233 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NdnP25233 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NdnP25233 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NdnP25233 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NdnP25233 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NdnP25233 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NdnP25233 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NdnP25233 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NdnP25233 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NdnP25233 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NdnP25233 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NdnP25233 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NdnP25233 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NdnP25233 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NdnP25233 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NdnP25233 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NdnP25233 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NdnP25233 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NdnP25233 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NdnP25233 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NdnP25233 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NdnP25233 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NdnP25233 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NdnP25233 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NdnP25233 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NdnP25233 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NdnP25233 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NdnP25233 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NdnP25233 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NdnP25233 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NdnP25233 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NdnP25233 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NdnP25233 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NdnP25233 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NdnP25233 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NdnP25233 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NdnP25233 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NdnP25233 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NdnP25233 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NdnP25233 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NdnP25233 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NdnP25233 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NdnP25233 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NdnP25233 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NdnP25233 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NdnP25233 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NdnP25233 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NdnP25233 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NdnP25233 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NdnP25233 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NdnP25233 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NdnP25233 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NdnP25233 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NdnP25233 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NdnP25233 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NdnP25233 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NdnP25233 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NdnP25233 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NdnP25233 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NdnP25233 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NdnP25233 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NdnP25233 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NdnP25233 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NdnP25233 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NdnP25233 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NdnP25233 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NdnP25233 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NdnP25233 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NdnP25233 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NdnP25233 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NdnP25233 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NdnP25233 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NdnP25233 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NdnP25233 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NdnP25233 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NdnP25233 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NdnP25233 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NdnP25233 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NdnP25233 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NdnP25233 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NdnP25233 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NdnP25233 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NdnP25233 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NdnP25233 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NdnP25233 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NdnP25233 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NdnP25233 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms