Protein–RNA interactions for Protein: P23772

Gata3, Trans-acting T-cell-specific transcription factor GATA-3, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata3P23772 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gata3P23772 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gata3P23772 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gata3P23772 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gata3P23772 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gata3P23772 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gata3P23772 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gata3P23772 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gata3P23772 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gata3P23772 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gata3P23772 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gata3P23772 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gata3P23772 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gata3P23772 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gata3P23772 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gata3P23772 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gata3P23772 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gata3P23772 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gata3P23772 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gata3P23772 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gata3P23772 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gata3P23772 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gata3P23772 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gata3P23772 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gata3P23772 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gata3P23772 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gata3P23772 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gata3P23772 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gata3P23772 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gata3P23772 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gata3P23772 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gata3P23772 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gata3P23772 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gata3P23772 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gata3P23772 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gata3P23772 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gata3P23772 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gata3P23772 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gata3P23772 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gata3P23772 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gata3P23772 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Gata3P23772 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gata3P23772 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gata3P23772 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata3P23772 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms