Protein–RNA interactions for Protein: P23708

Nfya, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfyaP23708 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NfyaP23708 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NfyaP23708 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NfyaP23708 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NfyaP23708 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NfyaP23708 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NfyaP23708 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NfyaP23708 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfyaP23708 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfyaP23708 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfyaP23708 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfyaP23708 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfyaP23708 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfyaP23708 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfyaP23708 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfyaP23708 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfyaP23708 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfyaP23708 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfyaP23708 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfyaP23708 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfyaP23708 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfyaP23708 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfyaP23708 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfyaP23708 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfyaP23708 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfyaP23708 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfyaP23708 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfyaP23708 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfyaP23708 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfyaP23708 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfyaP23708 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfyaP23708 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfyaP23708 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfyaP23708 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfyaP23708 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NfyaP23708 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NfyaP23708 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NfyaP23708 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NfyaP23708 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NfyaP23708 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NfyaP23708 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NfyaP23708 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NfyaP23708 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NfyaP23708 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NfyaP23708 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NfyaP23708 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfyaP23708 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfyaP23708 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfyaP23708 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NfyaP23708 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfyaP23708 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfyaP23708 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfyaP23708 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NfyaP23708 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NfyaP23708 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NfyaP23708 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NfyaP23708 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NfyaP23708 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NfyaP23708 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfyaP23708 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfyaP23708 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfyaP23708 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfyaP23708 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfyaP23708 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NfyaP23708 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfyaP23708 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfyaP23708 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfyaP23708 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfyaP23708 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfyaP23708 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfyaP23708 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfyaP23708 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfyaP23708 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfyaP23708 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfyaP23708 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfyaP23708 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfyaP23708 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfyaP23708 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfyaP23708 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfyaP23708 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfyaP23708 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfyaP23708 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfyaP23708 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NfyaP23708 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfyaP23708 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfyaP23708 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfyaP23708 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfyaP23708 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfyaP23708 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfyaP23708 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfyaP23708 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfyaP23708 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfyaP23708 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NfyaP23708 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NfyaP23708 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NfyaP23708 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NfyaP23708 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NfyaP23708 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NfyaP23708 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NfyaP23708 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms