Protein–RNA interactions for Protein: P23611

Irf8, Interferon regulatory factor 8, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf8P23611 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irf8P23611 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irf8P23611 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irf8P23611 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irf8P23611 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irf8P23611 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irf8P23611 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irf8P23611 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irf8P23611 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irf8P23611 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irf8P23611 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irf8P23611 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irf8P23611 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irf8P23611 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irf8P23611 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irf8P23611 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irf8P23611 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Irf8P23611 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Irf8P23611 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irf8P23611 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irf8P23611 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irf8P23611 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irf8P23611 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irf8P23611 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irf8P23611 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Irf8P23611 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irf8P23611 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irf8P23611 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irf8P23611 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irf8P23611 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irf8P23611 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Irf8P23611 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Irf8P23611 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irf8P23611 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Irf8P23611 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Irf8P23611 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irf8P23611 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irf8P23611 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irf8P23611 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf8P23611 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf8P23611 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf8P23611 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf8P23611 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf8P23611 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf8P23611 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf8P23611 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf8P23611 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf8P23611 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf8P23611 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf8P23611 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf8P23611 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf8P23611 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf8P23611 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf8P23611 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf8P23611 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf8P23611 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf8P23611 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irf8P23611 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irf8P23611 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irf8P23611 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irf8P23611 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irf8P23611 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irf8P23611 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irf8P23611 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irf8P23611 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irf8P23611 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irf8P23611 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irf8P23611 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irf8P23611 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irf8P23611 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irf8P23611 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irf8P23611 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irf8P23611 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irf8P23611 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irf8P23611 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Irf8P23611 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irf8P23611 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irf8P23611 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irf8P23611 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irf8P23611 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irf8P23611 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irf8P23611 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Irf8P23611 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irf8P23611 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irf8P23611 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irf8P23611 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irf8P23611 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irf8P23611 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irf8P23611 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irf8P23611 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irf8P23611 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irf8P23611 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irf8P23611 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irf8P23611 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irf8P23611 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irf8P23611 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irf8P23611 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irf8P23611 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irf8P23611 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Irf8P23611 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms