Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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Ggta1P23336 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ggta1P23336 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ggta1P23336 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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Ggta1P23336 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Ggta1P23336 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Ggta1P23336 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ggta1P23336 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ggta1P23336 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ggta1P23336 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Ggta1P23336 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
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Ggta1P23336 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ggta1P23336 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Ggta1P23336 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Ggta1P23336 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ggta1P23336 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ggta1P23336 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ggta1P23336 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ggta1P23336 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ggta1P23336 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ggta1P23336 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ggta1P23336 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ggta1P23336 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ggta1P23336 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ggta1P23336 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ggta1P23336 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ggta1P23336 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ggta1P23336 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ggta1P23336 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ggta1P23336 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ggta1P23336 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ggta1P23336 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ggta1P23336 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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